Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r200Q8R281 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms