Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssh3Q8K330 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms