Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Mrpl47Q8K2Y7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Mrpl47Q8K2Y7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Mrpl47Q8K2Y7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Mrpl47Q8K2Y7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Mrpl47Q8K2Y7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Mrpl47Q8K2Y7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Mrpl47Q8K2Y7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Mrpl47Q8K2Y7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Mrpl47Q8K2Y7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Mrpl47Q8K2Y7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Mrpl47Q8K2Y7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Mrpl47Q8K2Y7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Mrpl47Q8K2Y7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Mrpl47Q8K2Y7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Mrpl47Q8K2Y7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Mrpl47Q8K2Y7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Mrpl47Q8K2Y7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Mrpl47Q8K2Y7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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