Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc12Q8K2L8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc12Q8K2L8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms