Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms