Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trip10Q8CJ53 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms