Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIR4

Trpm6, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm6Q8CIR4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trpm6Q8CIR4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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