Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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