Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx8Q8CFD4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms