Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam228aQ8CDW1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms