Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms