Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB12

Gsdmc3, Gasdermin-C3, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsdmc3Q8CB12 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gsdmc3Q8CB12 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gsdmc3Q8CB12 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gsdmc3Q8CB12 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gsdmc3Q8CB12 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gsdmc3Q8CB12 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gsdmc3Q8CB12 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gsdmc3Q8CB12 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gsdmc3Q8CB12 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsdmc3Q8CB12 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms