Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms