Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9L1

BC106179, BC106179 protein, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC106179Q8C9L1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BC106179Q8C9L1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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BC106179Q8C9L1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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BC106179Q8C9L1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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BC106179Q8C9L1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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BC106179Q8C9L1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
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BC106179Q8C9L1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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BC106179Q8C9L1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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BC106179Q8C9L1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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BC106179Q8C9L1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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BC106179Q8C9L1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC106179Q8C9L1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms