Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Dclre1bQ8C7W7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Dclre1bQ8C7W7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Dclre1bQ8C7W7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Dclre1bQ8C7W7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dclre1bQ8C7W7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Dclre1bQ8C7W7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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