Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Y0

4930572O03Rik, RIKEN cDNA 4930572O03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930572O03RikQ8C5Y0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms