Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cwc22Q8C5N3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cwc22Q8C5N3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cwc22Q8C5N3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cwc22Q8C5N3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cwc22Q8C5N3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cwc22Q8C5N3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cwc22Q8C5N3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cwc22Q8C5N3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cwc22Q8C5N3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cwc22Q8C5N3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cwc22Q8C5N3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cwc22Q8C5N3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cwc22Q8C5N3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cwc22Q8C5N3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cwc22Q8C5N3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cwc22Q8C5N3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cwc22Q8C5N3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cwc22Q8C5N3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cwc22Q8C5N3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cwc22Q8C5N3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cwc22Q8C5N3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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