Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg16l1Q8C0J2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Atg16l1Q8C0J2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Atg16l1Q8C0J2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Atg16l1Q8C0J2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Atg16l1Q8C0J2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Atg16l1Q8C0J2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Atg16l1Q8C0J2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Atg16l1Q8C0J2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Atg16l1Q8C0J2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Atg16l1Q8C0J2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Atg16l1Q8C0J2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg16l1Q8C0J2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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