Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccser1Q8C0C4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms