Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Tnfsfm13Q8BXS2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Tnfsfm13Q8BXS2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Tnfsfm13Q8BXS2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tnfsfm13Q8BXS2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tnfsfm13Q8BXS2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tnfsfm13Q8BXS2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tnfsfm13Q8BXS2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tnfsfm13Q8BXS2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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