Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms