Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmod1Q8BVA4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms