Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR07

Bicd1, Protein bicaudal D homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bicd1Q8BR07 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bicd1Q8BR07 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bicd1Q8BR07 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bicd1Q8BR07 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bicd1Q8BR07 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bicd1Q8BR07 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bicd1Q8BR07 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bicd1Q8BR07 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bicd1Q8BR07 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bicd1Q8BR07 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms