Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Nop53Q8BK35 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Nop53Q8BK35 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Nop53Q8BK35 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Nop53Q8BK35 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Nop53Q8BK35 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Nop53Q8BK35 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nop53Q8BK35 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop53Q8BK35 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms