Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX2

Timm29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm29Q8BGX2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Timm29Q8BGX2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms