Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4dQ8BGV9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Atg4dQ8BGV9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Atg4dQ8BGV9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Atg4dQ8BGV9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Atg4dQ8BGV9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Atg4dQ8BGV9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Atg4dQ8BGV9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4dQ8BGV9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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