Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim6Q8BGE7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim6Q8BGE7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms