Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS9

Stkld1, Serine/threonine kinase-like domain-containing protein STKLD1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stkld1Q80YS9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Stkld1Q80YS9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stkld1Q80YS9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms