Protein–RNA interactions for Protein: Q80WR1

Tspan18, Tetraspanin-18, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan18Q80WR1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan18Q80WR1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms