Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Zbed4Q80WQ9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Zbed4Q80WQ9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Zbed4Q80WQ9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Zbed4Q80WQ9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Zbed4Q80WQ9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Zbed4Q80WQ9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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Zbed4Q80WQ9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms