Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc1Q80VQ1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms