Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms