Protein–RNA interactions for Protein: Q80TE0

Rpap1, RNA polymerase II-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap1Q80TE0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpap1Q80TE0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpap1Q80TE0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpap1Q80TE0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms