Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms