Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms