Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms