Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp397Q7TNK4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms