Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rnf139Q7TMV1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rnf139Q7TMV1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rnf139Q7TMV1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rnf139Q7TMV1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rnf139Q7TMV1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rnf139Q7TMV1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rnf139Q7TMV1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rnf139Q7TMV1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rnf139Q7TMV1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rnf139Q7TMV1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rnf139Q7TMV1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Rnf139Q7TMV1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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