Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Abcg2Q7TMS5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcg2Q7TMS5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms