Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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