Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TwistnbQ78WZ7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms