Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vma21Q78T54 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms