Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mindy1Q76LS9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mindy1Q76LS9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms