Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms