Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpv1Q704Y3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms