Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms