Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot1Q6ZQ08 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot1Q6ZQ08 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot1Q6ZQ08 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot1Q6ZQ08 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot1Q6ZQ08 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot1Q6ZQ08 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot1Q6ZQ08 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot1Q6ZQ08 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot1Q6ZQ08 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot1Q6ZQ08 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot1Q6ZQ08 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot1Q6ZQ08 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot1Q6ZQ08 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot1Q6ZQ08 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot1Q6ZQ08 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot1Q6ZQ08 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot1Q6ZQ08 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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