Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Glis3Q6XP49 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms