Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ssxb3Q6XAS4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ssxb3Q6XAS4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ssxb3Q6XAS4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssxb3Q6XAS4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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