Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms